Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H3Q13889 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H3Q13889 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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