Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTB1Q13884 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNTB1Q13884 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms