Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP1Q13829 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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TNFAIP1Q13829 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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