Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOFQ13790 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOFQ13790 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOFQ13790 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOFQ13790 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOFQ13790 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOFQ13790 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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