Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TDGQ13569 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDGQ13569 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDGQ13569 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDGQ13569 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDGQ13569 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDGQ13569 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDGQ13569 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDGQ13569 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDGQ13569 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TDGQ13569 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDGQ13569 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDGQ13569 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDGQ13569 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDGQ13569 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDGQ13569 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDGQ13569 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDGQ13569 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDGQ13569 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDGQ13569 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TDGQ13569 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDGQ13569 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDGQ13569 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDGQ13569 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms