Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD4Q13485 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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