Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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TOP3AQ13472 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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TOP3AQ13472 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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