Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX3Q13185 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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