Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF1Q13077 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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