Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRDM2Q13029 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PRDM2Q13029 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
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