Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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