Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF2Q12933 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms