Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN2Q12907 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMAN2Q12907 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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