Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROAPQ12815 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROAPQ12815 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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