Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAPQ12770 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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