Protein–RNA interactions for Protein: Q12754

RRP12, Ribosomal RNA-processing protein 12, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP12Q12754 PRP9YDL030W 1593 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 TRK1YJL129C 3708 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 MCD4YKL165C 2760 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 CWC2YDL209C 1020 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 RPS13YDR064W 456 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 PRE9YGR135W 777 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 MRPS35YGR165W 1038 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 PIR3YKL163W 978 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 PER33YLR064W 822 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 ERD2YBL040C 660 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 EOS1YNL080C 1101 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 GRX1YCL035C 333 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 RRP14YKL082C 1305 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 SSH1YBR283C 1473 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 KRE5YOR336W 4098 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 SEC2YNL272C 2280 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 AIM6YDL237W 1173 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 LSB1YGR136W 726 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 DCG1YIR030C 735 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 SAW1YAL027W 786 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 RUF20RUF20 443 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 YGK3YOL128C 1128 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 YOL075CYOL075C 3885 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 YNR065CYNR065C 3351 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 ARO80YDR421W 2853 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 KIP3YGL216W 2418 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 RAD54YGL163C 2697 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 TPA1YER049W 1935 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 SEG1YMR086W 2883 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 HSP30YCR021C 999 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 HSP42YDR171W 1128 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 AHA1YDR214W 1053 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 CNN1YFR046C 1086 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 YGR283CYGR283C 1026 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 HIS6YIL020C 786 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 SHE1YBL031W 1017 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 MDJ2YNL328C 441 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 TMA16YOR252W 537 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP12Q12754 KIN4YOR233W 2403 nt3.84□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YLR345WYLR345W 1530 nt3.84□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 AIM21YIR003W 2040 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 NTH1YDR001C 2256 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YCR015CYCR015C 954 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YCR085WYCR085W 354 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YCR101CYCR101C 549 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SHR3YDL212W 633 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 RNH202YDR279W 1053 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SPO73YER046W 432 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 ALB1YJL122W 528 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 PAM18YLR008C 507 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SEC72YLR292C 582 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YLR366WYLR366W 306 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SIW14YNL032W 846 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SSU72YNL222W 621 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YAR1YPL239W 603 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 FRM2YCL026C-A 582 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 GCD1YOR260W 1737 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 COP1YDL145C 3606 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 HPR1YDR138W 2259 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 BUD5YCR038C 1929 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 VPS45YGL095C 1734 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 ROK1YGL171W 1695 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 ALO1YML086C 1581 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 NAM9YNL137C 1461 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 RCR2YDR003W 633 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 PEX21YGR239C 867 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 PAN5YHR063C 1140 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 COX2Q0250 756 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 GCD7YLR291C 1146 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YOR314WYOR314W 330 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YPR142CYPR142C 564 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SLX1YBR228W 915 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 AIP1YMR092C 1848 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 MNL1YHR204W 2391 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YRM1YOR172W 2361 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 VAC17YCL063W 1272 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YDL158CYDL158C 309 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 RTA1YGR213C 954 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 YAL069WYAL069W 315 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 RPS10BYMR230W 318 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 WRS1YOL097C 1299 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 SLM4YBR077C 489 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 PWR1PWR1 941 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 BMT2YBR141C 1014 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 FAS2YPL231W 5664 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 APP1YNL094W 1764 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP12Q12754 TRM1YDR120C 1713 nt3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms