Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 MNT4YNR059W 1743 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 MSS2YDL107W 1056 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YEL074WYEL074W 339 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SLX8YER116C 825 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 COS12YGL263W 1143 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YHL045WYHL045W 348 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 CDC8YJR057W 651 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 PIR3YKL163W 978 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YMR084WYMR084W 789 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 snR17asnR17a 333 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 APL4YPR029C 2499 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 FLO10YKR102W 3510 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YHR173CYHR173C 339 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 DPH1YIL103W 1278 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 HRT3YLR097C 1035 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YGK3YOL128C 1128 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SPS4YOR313C 1017 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YOR342CYOR342C 960 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SCD6YPR129W 1050 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 TDA3YHR009C 1572 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 REB1YBR049C 2433 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 OSH3YHR073W 2991 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 GLO3YER122C 1482 nt3.53□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 MYO3YKL129C 3819 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 snR63snR63 255 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ATP12YJL180C 978 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 HTA2YBL003C 399 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 RAD10YML095C 633 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ARG80YMR042W 534 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YAR1YPL239W 603 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 POF1YCL047C 777 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 CTR86YCR054C 1692 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 BUD27YFL023W 2391 nt3.52□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 MRPL11YDL202W 750 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YDR271CYDR271C 372 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 PHM6YDR281C 315 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 TYS1YGR185C 1185 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 PDX1YGR193C 1233 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ARC15YIL062C 465 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 FMC1YIL098C 468 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 FLD1YLR404W 858 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 URA4YLR420W 1095 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ASI2YNL159C 870 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 TMA16YOR252W 537 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 MRPL37YBR268W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 RDS1YCR106W 2499 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ERB1YMR049C 2424 nt3.51□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 TAF1YGR274C 3201 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 RTS1YOR014W 2274 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 BUD6YLR319C 2367 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YDL241WYDL241W 372 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YDR222WYDR222W 1248 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 MSW1YDR268W 1140 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 CLC1YGR167W 702 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 CAP2YIL034C 864 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 RPC17YJL011C 486 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 IDH2YOR136W 1110 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 FDH1YOR388C 1131 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YSA1YBR111C 696 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 BMT2YBR141C 1014 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 DER1YBR201W 636 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 KRI1YNL308C 1776 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 POL1YNL102W 4407 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 SMP3YOR149C 1551 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 SPT16YGL207W 3108 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 NTA1YJR062C 1374 nt3.5□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 UBX5YDR330W 1503 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 RMD5YDR255C 1266 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 PEX21YGR239C 867 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YLR428CYLR428C 345 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 RET3YPL010W 570 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 HEF3YNL014W 3135 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 LTV1YKL143W 1392 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ROK1YGL171W 1695 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 GEM1YAL048C 1989 nt3.49□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ATG21YPL100W 1491 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ASI1YMR119W 1875 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ALO1YML086C 1581 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 VAC17YCL063W 1272 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 CDC73YLR418C 1182 nt3.48□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 PRP31YGR091W 1485 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 MSD1YPL104W 1977 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YDR161WYDR161W 1164 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YGR149WYGR149W 1299 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 MRPS35YGR165W 1038 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 CDC12YHR107C 1224 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 BET1YIL004C 429 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 YOR314WYOR314W 330 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 SNF8YPL002C 702 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 ECM8YBR076W 1065 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 DIT2YDR402C 1470 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 SPA2YLL021W 4401 nt3.47□□□□□ -1.85
RPN6Q12377 TED1YIL039W 1422 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 MSA1YOR066W 1890 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 RRN6YBL014C 2685 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 YHL026CYHL026C 948 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 COS8YHL048W 1146 nt3.46□□□□□ -1.86
RPN6Q12377 IRC25YLR021W 540 nt3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms