Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YBL077WYBL077W 432 nt3.45□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YOR186WYOR186W 435 nt3.45□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 CNS1YBR155W 1158 nt3.45□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 NRP1YDL167C 2160 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 GAT2YMR136W 1683 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 ORC4YPR162C 1590 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 HER2YMR293C 1395 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 DLS1YJL065C 504 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 RPS21AYKR057W 264 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YKR075CYKR075C 924 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YAR023CYAR023C 540 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YIM2YMR151W 438 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 TRI1YMR233W 681 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 MPD1YOR288C 957 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 CTR1YPR124W 1221 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 IMH1YLR309C 2736 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SMI1YGR229C 1518 nt3.44□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 UBP12YJL197W 3765 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 RPN2YIL075C 2838 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 USA1YML029W 2517 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SEC6YIL068C 2418 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 APN2YBL019W 1563 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 IMD4YML056C 1575 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 QRI7YDL104C 1224 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 CDC8YJR057W 651 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YKT6YKL196C 603 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 RPS7AYOR096W 573 nt3.43□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 CHA4YLR098C 1947 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 NOG1YPL093W 1944 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 PGS1YCL004W 1566 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 PRS5YOL061W 1491 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 BUD30YDL151C 582 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 PRR2YDL214C 2100 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 GTF1YGR102C 552 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YJR038CYJR038C 363 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YLR049CYLR049C 1287 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 COQ5YML110C 924 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 CCS1YMR038C 750 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YOR131CYOR131C 657 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YPL162CYPL162C 822 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 ETP1YHL010C 1758 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 YBR238CYBR238C 2196 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 CSR2YPR030W 3366 nt3.42□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 RRN7YJL025W 1545 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 STE14YDR410C 720 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 PAD1YDR538W 729 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SDT1YGL224C 843 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 EMG1YLR186W 759 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 ATG33YLR356W 594 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SSO2YMR183C 888 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 PPA2YMR267W 933 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SRO9YCL037C 1305 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SQS1YNL224C 2304 nt3.41□□□□□ -1.86
MSH5Q12175 SER3YER081W 1410 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 ERV29YGR284C 933 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YJL028WYJL028W 336 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YKL177WYKL177W 339 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 FAR8YMR029C 1572 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RRP5YMR229C 5190 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YNL013CYNL013C 378 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RPN6YDL097C 1305 nt3.4□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 FOX2YKR009C 2703 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 PTM1YKL039W 1572 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YAK1YJL141C 2424 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YDR249CYDR249C 1122 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YIL086CYIL086C 309 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 POG1YIL122W 1056 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 ACP1YKL192C 378 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 TVP18YMR071C 504 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 TMC1YOR052C 453 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 AUS1YOR011W 4185 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 SIZ1YDR409W 2715 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 KTR6YPL053C 1341 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 THR4YCR053W 1545 nt3.39□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RSF2YJR127C 4143 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 CDC45YLR103C 1953 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RHO5YNL180C 996 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RAD4YER162C 2265 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 ROD1YOR018W 2514 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 CUS1YMR240C 1311 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RPN1YHR027C 2982 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 ALG1YBR110W 1350 nt3.38□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MEK1YOR351C 1494 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RMD1YDL001W 1293 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 TRP4YDR354W 1143 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YJL220WYJL220W 453 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 SPC3YLR066W 555 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YBR016WYBR016W 387 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 CAF130YGR134W 3369 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 SNT1YCR033W 3681 nt3.37□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 EPO1YMR124W 2832 nt3.37□□□□□ -1.87
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