Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 YLL017WYLL017W 312 nt2.41□□□□□ -2.02
CCW12Q12127 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.41□□□□□ -2.02
CCW12Q12127 YGK3YOL128C 1128 nt2.41□□□□□ -2.02
CCW12Q12127 SPO14YKR031C 5052 nt2.41□□□□□ -2.02
CCW12Q12127 FLO10YKR102W 3510 nt2.41□□□□□ -2.02
CCW12Q12127 YCR050CYCR050C 309 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 ECO1YFR027W 846 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YGR291CYGR291C 222 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 UIP3YAR027W 708 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 MET16YPR167C 786 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 MAD3YJL013C 1548 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 BAR1YIL015W 1764 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 NOP4YPL043W 2058 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 NTO1YPR031W 2247 nt2.4□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PRP8YHR165C 7242 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 ERB1YMR049C 2424 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 VTC4YJL012C 2166 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YDR444WYDR444W 2064 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 OPI6YDL096C 327 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 DET1YDR051C 1005 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 FMP32YFL046W 624 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 DOG2YHR043C 741 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 TIF34YMR146C 1044 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RPL18AYOL120C 561 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 FDH2YPL275W 711 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PRR2YDL214C 2100 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RAD4YER162C 2265 nt2.39□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 TDA1YMR291W 1761 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 CDC40YDR364C 1368 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RRN7YJL025W 1545 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YLR345WYLR345W 1530 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 ROK1YGL171W 1695 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PRP22YER013W 3438 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YOR296WYOR296W 3870 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 UBP5YER144C 2418 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PET54YGR222W 882 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YKT6YKL196C 603 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YML053CYML053C 639 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YPL073CYPL073C 486 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 THI22YPR121W 1719 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RGP1YDR137W 1992 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YHR202WYHR202W 1809 nt2.38□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 POL3YDL102W 3294 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RIF1YBR275C 5751 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 TSR1YDL060W 2367 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 STE23YLR389C 3084 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 DYN1YKR054C 12279 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 SIP1YDR422C 2448 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 BDP1YNL039W 1785 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 VAC17YCL063W 1272 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 NOP6YDL213C 678 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 AI5_BETAQ0075 1065 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 AGE2YIL044C 897 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YAR070CYAR070C 300 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RHO5YNL180C 996 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YPL088WYPL088W 1029 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 snR17asnR17a 333 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 HUT1YPL244C 1020 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 AGA1YNR044W 2178 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PCL10YGL134W 1302 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 FLO9YAL063C 3969 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 LCB5YLR260W 2064 nt2.37□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RPA190YOR341W 4995 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YPS6YIR039C 1614 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YAK1YJL141C 2424 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 APA2YDR530C 978 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YPT35YHR105W 645 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 COX23YHR116W 456 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RSM25YIL093C 795 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YIL175WYIL175W 318 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YBL029WYBL029W 1131 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YPL014WYPL014W 1146 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 GGA1YDR358W 1674 nt2.36□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 ULP1YPL020C 1866 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 ZDS2YML109W 2829 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 SOF1YLL011W 1470 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RCR2YDR003W 633 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PAU10YDR542W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PAU11YGL261C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 SCM4YGR049W 564 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 TOM20YGR082W 552 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PAU13YHL046C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 YIL152WYIL152W 708 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 MRP8YKL142W 660 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 RPC37YKR025W 849 nt2.35□□□□□ -2.03
CCW12Q12127 PAU4YLR461W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms