Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 AIP1YMR092C 1848 nt4.02□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 GEM1YAL048C 1989 nt4.02□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 BUD6YLR319C 2367 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YCR007CYCR007C 720 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 NOP6YDL213C 678 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 GVP36YIL041W 981 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 GLO4YOR040W 858 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 GDT1YBR187W 843 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 PRP9YDL030W 1593 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SSL1YLR005W 1386 nt4.01□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 TAF7YMR227C 1773 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YCR085WYCR085W 354 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SUP56tL(CAA)A 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SUP53tL(CAA)C 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YAL065CYAL065C 387 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 NIT3YLR351C 876 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 RSF1YMR030W 1131 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 CYC2YOR037W 1101 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 GRS2YPR081C 1857 nt4□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 MCD4YKL165C 2760 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YDR290WYDR290W 330 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 ADH4YGL256W 1149 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 PSF3YOL146W 585 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 FSH3YOR280C 801 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 POC4YPL144W 447 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SSU1YPL092W 1377 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 RPO31YOR116C 4383 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 TRK1YJL129C 3708 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 AIM14YGL160W 1713 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 RPC11YDR045C 333 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 DDI2YFL061W 678 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YHI9YHR029C 885 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YML053CYML053C 639 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YMR178WYMR178W 825 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 MRPS17YMR188C 714 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 NRK1YNL129W 723 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 ASI2YNL159C 870 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 DDI3YNL335W 678 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YBL096CYBL096C 309 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 IDH2YOR136W 1110 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 TAF14YPL129W 735 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 OPY1YBR129C 987 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 NTH1YDR001C 2256 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SEG1YMR086W 2883 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YDR391CYDR391C 699 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 ERV29YGR284C 933 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 REE1YJL217W 597 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SRP40YKR092C 1221 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 MCM1YMR043W 861 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 IRC14YOR135C 342 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 STP22YCL008C 1158 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 PMS1YNL082W 2622 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 MTC4YBR255W 2085 nt3.96□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 SHU2YDR078C 672 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 GTF1YGR102C 552 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 YIL025CYIL025C 375 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 RSM25YIL093C 795 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 RFM1YOR279C 933 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 YOR314WYOR314W 330 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 PUB1YNL016W 1362 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 AGA1YNR044W 2178 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 MEF1YLR069C 2286 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 MNL1YHR204W 2391 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 PEP7YDR323C 1548 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 YRM1YOR172W 2361 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 RCR2YDR003W 633 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 CTH1YDR151C 978 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 IES6YEL044W 501 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 ELF1YKL160W 438 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 TMC1YOR052C 453 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 PNT1YOR266W 1272 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 SPT23YKL020C 3249 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 KIP3YGL216W 2418 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 RPS13YDR064W 456 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 DPH1YIL103W 1278 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 LAC1YKL008C 1257 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 MTR2YKL186C 555 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 TRM1YDR120C 1713 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 PST1YDR055W 1335 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 APL4YPR029C 2499 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 YDL186WYDL186W 834 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 YAL069WYAL069W 315 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 RPL18AYOL120C 561 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 RTS1YOR014W 2274 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 PRS5YOL061W 1491 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 YFL040WYFL040W 1623 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 MNR2YKL064W 2910 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS54Q12071 NOG1YPL093W 1944 nt3.92□□□□□ -1.78
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