Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 ARR1YPR199C 885 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 IOC4YMR044W 1428 nt2.83□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 JJJ1YNL227C 1773 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YSP2YDR326C 4317 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 PCL6YER059W 1263 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YFL051CYFL051C 483 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 MRP13YGR084C 1020 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 RPN13YLR421C 471 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 DSC2YOL073C 969 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 BSD2YBR290W 966 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 GLO3YER122C 1482 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YPS6YIR039C 1614 nt2.82□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 GEM1YAL048C 1989 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YAK1YJL141C 2424 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 PEX1YKL197C 3132 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 CPR1YDR155C 489 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 HIM1YDR317W 1245 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 FOL3YMR113W 1284 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 IDH2YOR136W 1110 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 RPL20BYOR312C 519 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YPL162CYPL162C 822 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 ALG5YPL227C 1005 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 OPY1YBR129C 987 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 RRN7YJL025W 1545 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 APN2YBL019W 1563 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 VPS17YOR132W 1656 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 UBP10YNL186W 2379 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 MNR2YKL064W 2910 nt2.81□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 ALE1YOR175C 1860 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 ROK1YGL171W 1695 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 ALG11YNL048W 1647 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 VAC17YCL063W 1272 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 NOP6YDL213C 678 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 MRPL25YGR076C 474 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 BET1YIL004C 429 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 SGN1YIR001C 753 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 MRP8YKL142W 660 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 SEC14YMR079W 915 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 RPL18AYOL120C 561 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 HUT1YPL244C 1020 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 ARO1YDR127W 4767 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 GCD6YDR211W 2139 nt2.8□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 GSC2YGR032W 5688 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 FLO10YKR102W 3510 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 APL4YPR029C 2499 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 PRP31YGR091W 1485 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 SEA4YBL104C 3117 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 PHM6YDR281C 315 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 AI5_BETAQ0075 1065 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YIL025CYIL025C 375 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 RPC37YKR025W 849 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YML053CYML053C 639 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YNL143CYNL143C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YNR063WYNR063W 1824 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 MIH1YMR036C 1665 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 RKM3YBR030W 1659 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 UBP14YBR058C 2346 nt2.79□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 PEP7YDR323C 1548 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 CHO2YGR157W 2610 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 DSD1YGL196W 1287 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YKT6YKL196C 603 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 UPS2YLR168C 693 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 SFH1YLR321C 1281 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 YOR342CYOR342C 960 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 NIP7YPL211W 546 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 ISA2YPR067W 558 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 NMD2YHR077C 3270 nt2.78□□□□□ -1.96
ATG41Q12048 DOA4YDR069C 2781 nt2.78□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 POL31YJR006W 1464 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 GPB1YOR371C 2694 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 CDC40YDR364C 1368 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YRB30YGL164C 1323 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 NOP4YPL043W 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YGL262WYGL262W 528 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YHB1YGR234W 1200 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 DAL2YIR029W 1032 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 EMG1YLR186W 759 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 ARG80YMR042W 534 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 IMP1YMR150C 573 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 snR17asnR17a 333 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 MRPL51YPR100W 423 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 SIP1YDR422C 2448 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YHR080CYHR080C 4038 nt2.77□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 GAS2YLR343W 1668 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PRR2YDL214C 2100 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 RSM25YIL093C 795 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 ATP12YJL180C 978 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 AHP1YLR109W 531 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YLR297WYLR297W 390 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 VPS71YML041C 843 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 IST1YNL265C 897 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 DIM1YPL266W 957 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 CMR3YPR013C 954 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PMT6YGR199W 2280 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms