Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACSM2AQ08AH3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACSM2AQ08AH3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms