Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YNR062CYNR062C 984 nt4.73□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 UBX7YBR273C 1311 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YIL001WYIL001W 1542 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 GMC1YDR506C 1827 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 FOX2YKR009C 2703 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YEL010WYEL010W 351 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 GVP36YIL041W 981 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 ATG38YLR211C 681 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 TRI1YMR233W 681 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 RRN9YMR270C 1098 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 PFK27YOL136C 1194 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YOR338WYOR338W 1092 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YOR364WYOR364W 369 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 YCL012CYCL012C 405 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 SOF1YLL011W 1470 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 LYP1YNL268W 1836 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 MRS2YOR334W 1413 nt4.72□□□□□ -1.65
SGO1Q08490 CIK1YMR198W 1785 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 THI20YOL055C 1656 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 FOL2YGR267C 732 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PPX1YHR201C 1194 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SDS22YKL193C 1017 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YAR069CYAR069C 294 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YMR099CYMR099C 894 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YMR315WYMR315W 1050 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SYC1YOR179C 567 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YPL114WYPL114W 420 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 HUT1YPL244C 1020 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 TRM44YPL030W 1704 nt4.71□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 KAR2YJL034W 2049 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 CTK1YKL139W 1587 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SSA2YLL024C 1920 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 BOP2YLR267W 1713 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 NHP10YDL002C 612 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 RXT3YDL076C 885 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 RPL35BYDL136W 363 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SUR2YDR297W 1050 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 TLG1YDR468C 675 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YHR173CYHR173C 339 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PNG1YPL096W 1092 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 MPS3YJL019W 2049 nt4.7□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 ESF1YDR365C 1887 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YGR266WYGR266W 2106 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 HIR2YOR038C 2628 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 RRP3YHR065C 1506 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 TAF8YML114C 1533 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YEL045CYEL045C 426 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YEL067CYEL067C 588 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YGR226CYGR226C 210 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 MTM1YGR257C 1101 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 ARC15YIL062C 465 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 UBI4YLL039C 1146 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 IMP2YMR035W 534 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YMR085WYMR085W 1299 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 TRE2YOR256C 2430 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 UTP5YDR398W 1932 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 GZF3YJL110C 1656 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 IOC4YMR044W 1428 nt4.69□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 ABF1YKL112W 2196 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PUF2YPR042C 3228 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PDS1YDR113C 1122 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 EMC4YGL231C 573 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 BAT2YJR148W 1131 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YML047W-AYML047W-A 366 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YCL007CYCL007C 393 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YMR102CYMR102C 2505 nt4.68□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 RKM3YBR030W 1659 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PAN1YIR006C 4443 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SLI1YGR212W 1407 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YCR108CYCR108C 192 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 DAS2YDR020C 699 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PET100YDR079W 336 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 DPB4YDR121W 591 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YAP6YDR259C 1152 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YDR417CYDR417C 372 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 RNA15YGL044C 891 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 DAM1YGR113W 1032 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 PEX18YHR160C 852 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YLR444CYLR444C 303 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 BUD21YOR078W 645 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SUR1YPL057C 1149 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 CUP9YPL177C 921 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 FDH2YPL275W 711 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 RPL19AYBR084C-A 570 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 HRK1YOR267C 2280 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 LEU1YGL009C 2340 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 GAT2YMR136W 1683 nt4.67□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 YIG1YPL201C 1386 nt4.66□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 FRE1YLR214W 2061 nt4.66□□□□□ -1.66
SGO1Q08490 SNU23YDL098C 585 nt4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.9 ms