Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GOLGA3Q08378 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
GOLGA3Q08378 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GOLGA3Q08378 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms