Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDR1Q08345 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms