Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNB2Q08289 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms