Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP3CAQ08209 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP3CAQ08209 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP3CAQ08209 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms