Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 IPP1YBR011C 864 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 INA17YPL099C 549 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 CCL1YPR025C 1182 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 KEX1YGL203C 2190 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MAL12YGR292W 1755 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MAL32YBR299W 1755 nt3.89□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 IKS1YJL057C 2004 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MAG2YLR427W 2013 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 HOS3YPL116W 2094 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PTA1YAL043C 2358 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 TRF5YNL299W 1929 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 THI13YDL244W 1023 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RAD55YDR076W 1221 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YFR045WYFR045W 930 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 KXD1YGL079W 657 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PRP18YGR006W 756 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YJR096WYJR096W 849 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 THI11YJR156C 1023 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MCM1YMR043W 861 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MFM1YPL060W 1242 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PBN1YCL052C 1251 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 EMP47YFL048C 1338 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SUP45YBR143C 1314 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PIM1YBL022C 3402 nt3.88□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 NHX1YDR456W 1902 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SAF1YBR280C 1914 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 VHS3YOR054C 2025 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 APP1YNL094W 1764 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 NOP58YOR310C 1536 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YCR007CYCR007C 720 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 NBP2YDR162C 711 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YIL165CYIL165C 360 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 snR44snR44 211 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 CEG1YGL130W 1380 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MIS1YBR084W 2928 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PMS1YNL082W 2622 nt3.87□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MNN4YKL201C 3537 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 ALE1YOR175C 1860 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 HPR1YDR138W 2259 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MEF1YLR069C 2286 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MIC60YKR016W 1623 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RPS11AYDR025W 471 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 AI3Q0060 1248 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 DET1YDR051C 1005 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PRE9YGR135W 777 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RTA1YGR213C 954 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SOL4YGR248W 768 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 BIO2YGR286C 1128 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MTR2YKL186C 555 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MAP1YLR244C 1164 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 END3YNL084C 1050 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 HAP4YKL109W 1665 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 FLO8YER109C 2400 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PSY4YBL046W 1326 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SSH1YBR283C 1473 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 ULS1YOR191W 4860 nt3.86□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YML020WYML020W 1995 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SNF2YOR290C 5112 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YDL094CYDL094C 510 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RPL35BYDL136W 363 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 MEI4YER044C-A 1227 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YFL012WYFL012W 447 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YFR057WYFR057W 456 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SAE3YHR079C-A 276 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 ERG20YJL167W 1059 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RAD27YKL113C 1149 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YRA2YKL214C 612 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YLR339CYLR339C 552 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 HTA2YBL003C 399 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 OSW1YOR255W 837 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 TYE7YOR344C 876 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 GRX5YPL059W 453 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YPR027CYPR027C 834 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 OPY1YBR129C 987 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 CLG1YGL215W 1359 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YIL001WYIL001W 1542 nt3.85□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 YCF1YDR135C 4548 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 GAL11YOL051W 3246 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 AIR1YIL079C 1083 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PSF2YJL072C 642 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 FIP1YJR093C 984 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 RCE1YMR274C 948 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 SYC1YOR179C 567 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 PRM4YPL156C 855 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 JHD2YJR119C 2187 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 NUF2YOL069W 1356 nt3.84□□□□□ -1.79
SSK1Q07084 TCO89YPL180W 2400 nt3.84□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 BOI2YER114C 3123 nt3.84□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 TPA1YER049W 1935 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 HSP42YDR171W 1128 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 COS12YGL263W 1143 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.83□□□□□ -1.8
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