Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX4Q06945 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms