Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FMODQ06828 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FMODQ06828 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FMODQ06828 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FMODQ06828 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FMODQ06828 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FMODQ06828 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FMODQ06828 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms