Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms