Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALD1Q05682 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CALD1Q05682 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms