Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSBP1Q04837 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms