Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELAQ04206 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELAQ04206 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELAQ04206 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RELAQ04206 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RELAQ04206 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELAQ04206 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RELAQ04206 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RELAQ04206 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELAQ04206 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RELAQ04206 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELAQ04206 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELAQ04206 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RELAQ04206 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RELAQ04206 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms