Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YPL077C	YPL077C	723 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	BMT2	YBR141C	1014 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	SLA1	YBL007C	3735 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	SPO73	YER046W	432 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	SPI1	YER150W	447 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YGR149W	YGR149W	1299 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	BUD6	YLR319C	2367 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	ROK1	YGL171W	1695 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	PUB1	YNL016W	1362 nt		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YSH1	YLR277C	2340 nt		4.4	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	RPC17	YJL011C	486 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YUH1	YJR099W	711 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	POF1	YCL047C	777 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	RNA14	YMR061W	2034 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YDR271C	YDR271C	372 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	MRPL6	YHR147C	645 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	RPL19B	YBL027W	570 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	FOL3	YMR113W	1284 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	RDS1	YCR106W	2499 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PAU10	YDR542W	363 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PAU11	YGL261C	363 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PAU13	YHL046C	363 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YJL218W	YJL218W	591 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	OMA1	YKR087C	1038 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PAU4	YLR461W	363 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YBL094C	YBL094C	333 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YBR053C	YBR053C	1077 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	HCM1	YCR065W	1695 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	NCR1	YPL006W	3513 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	MSA1	YOR066W	1890 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	CTK1	YKL139W	1587 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PMS1	YNL082W	2622 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	WSS1	YHR134W	810 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YSA1	YBR111C	696 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	TEL1	YBL088C	8364 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	MGR3	YMR115W	1506 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	NUG1	YER006W	1563 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	ALO1	YML086C	1581 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	CHK1	YBR274W	1584 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	POL1	YNL102W	4407 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	AAD10	YJR155W	867 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	NDJ1	YOL104C	1059 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	FDH1	YOR388C	1131 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YCL076W	YCL076W	744 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YCR007C	YCR007C	720 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	NOP6	YDL213C	678 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	POP6	YGR030C	477 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YHI9	YHR029C	885 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YAL065C	YAL065C	387 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YLR428C	YLR428C	345 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	IMP4	YNL075W	873 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	YPT53	YNL093W	663 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	POC4	YPL144W	447 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	AIM14	YGL160W	1713 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	MTC3	YGL226W	372 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	REE1	YJL217W	597 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	SPO20	YMR017W	1194 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	PSF3	YOL146W	585 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	IAH1	YOR126C	717 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	CMK1	YFR014C	1341 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	BUD5	YCR038C	1929 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	SPT10	YJL127C	1923 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	Q04048	BCK2	YER167W	2556 nt		4.34	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	HMG1	YML075C	3165 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	VHS3	YOR054C	2025 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YLR446W	YLR446W	1302 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	GTF1	YGR102C	552 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	ERV29	YGR284C	933 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	PAM18	YLR008C	507 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YPK9	YOR291W	4419 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	HOS3	YPL116W	2094 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	CDC45	YLR103C	1953 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	CLN2	YPL256C	1638 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	GPI2	YPL076W	843 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	TAF14	YPL129W	735 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	HUT1	YPL244C	1020 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	GRX1	YCL035C	333 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	VID27	YNL212W	2349 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	MEF1	YLR069C	2286 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	FAT1	YBR041W	2010 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	SRP72	YPL210C	1923 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	RPC11	YDR045C	333 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YDR290W	YDR290W	330 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	DID4	YKL002W	699 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.31	□□□□□ -1.72

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