Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR3Q03167 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms