Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms