Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms