Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms