Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDPQ00604 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDPQ00604 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDPQ00604 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms