Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGD1P98174 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGD1P98174 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD1P98174 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD1P98174 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD1P98174 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD1P98174 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms