Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms