Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP5P82980 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP5P82980 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP5P82980 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms