Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS9P82933 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS9P82933 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms