Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUCB2P80303 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB2P80303 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms