Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELF3P78545 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELF3P78545 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELF3P78545 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELF3P78545 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELF3P78545 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELF3P78545 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELF3P78545 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELF3P78545 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELF3P78545 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELF3P78545 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ELF3P78545 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms