Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX1P78337 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX1P78337 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX1P78337 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms