Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCD1P59942 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCCD1P59942 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCD1P59942 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms