Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00313P59037 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00313P59037 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms