Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD2BP57060 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RWDD2BP57060 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms